Денежные средства, полученные бюджетным или автономным учреждением от продажи недвижимого имущества, не поименованы в закрытом перечне операций, не учитываемых при определении налоговой базы по налогу на прибыль. На этом основании Минфин приходит к выводу о том, что эти доходы подлежат обложению налогом на прибыль организаций в общеустановленном порядке. При этом финансовое ведомство полагает возможным уменьшить доходы от продажи на остаточную стоимость объекта недвижимости.
Однако уменьшить доходы от продажи на остаточную стоимость объекта недвижимости учреждение, как правило, не может, поскольку такое имущество обычно приобретается за счет целевых средств либо целевых поступлений и не является амортизируемым. Следовательно, как ранее отмечалось в письмах Минфина и ФНС России, учреждение не вправе признать в расходах стоимость имущества, приобретенного за счет целевых средств.
Вместе с тем доходы от продажи недвижимого имущества, закрепленного за бюджетным или автономным учреждением на праве оперативного управления, являются неналоговыми доходами соответствующего бюджета. Денежные средства от реализации недвижимого имущества, закрепленного за бюджетным или автономным учреждением на праве оперативного управления, подлежат перечислению в соответствующий бюджет по нормативу 100 процентов.
При перечислении в полном объеме денежных средств, полученных от реализации недвижимого имущества, в доход бюджета у учреждения не возникает экономической выгоды в понимании норм Налогового кодекса. Следовательно, учреждение не получает доход, и у него не возникает обязанности по уплате налога на прибыль организаций. Этот вывод был подтвержден в судебных решениях.
Окончательное решение вопроса, уплачивать ли налог на прибыль при продаже недвижимости, остается за учреждением. Если доходы от сделки не включать в доходы от реализации, то такую позицию, возможно, придется отстаивать в суде (Письмо Минфина России от 8 августа 2024 г. № 03-03-06/3/74339).

Источник