Это можно узнать из письма ФНС от 27.12.2023 № БВ-4-7/16343@.

По общему правилу, установленному ст. 81 НК РФ, уточненная декларация подается в налоговую в случае выявления ошибок в предыдущей декларации. Если такие ошибки не увеличивают обязательства, представление уточненки является правом налогоплательщика, а если налог необходимо доплатить, то это обязанность.
Представление уточненной декларации с плюсом после наступления срока уплаты ведет к возникновению задолженности, и налоговики могут оштрафовать за несвоевременную уплату доначисленных налогов в размере 20 % от такой суммы.

Факты допущенных нарушений и недоплаты налога отражаются в акте проверки. При этом требование налоговых сотрудников дать пояснения до оформления акта само по себе не подтверждает наличие таких фактов.

Кроме того, налоговики не выпишут штраф, если плюсовая уточненка подана после выездной проверки, не выявившей нарушения.
Вместе с тем служба отмечает, что недоимка не возникнет, если на едином счете есть положительное сальдо не менее недоплаченной суммы. В этом случае оснований для штрафа нет. Также покроют недоимку суммы, зарезервированные в счет уплаты других налогов, так как при необходимости оплаты задолженности они исключаются из резерва и поступают на единый счет. Кроме того, при наличии положительного сальдо или зарезервированных налогов на уточненную сумму не будет начисляться пеня. Для того чтобы штрафы и пени не начислялись, сальдо должно быть плюсовым весь период от срока уплаты до подачи уточненной декларации.

Отдельно ФНС обращает внимание на то, что при подаче уточненки к доплате за периоды до 2023 г. учитываются переплата по конкретному налогу до 1 января 2023 г. и положительное сальдо после этой даты.

Также в письме указаны обстоятельства, которые помогут смягчить наказание. Если переплаты на ЕНС нет, или она не полностью покрывает возникшую в связи с представлением уточненной декларации недоимку, размер штрафных санкций может быть снижен. Так, самостоятельное выявление налогоплательщиком ошибок в декларации и уточнение своих обязательств рассматривается как смягчающее вину обстоятельство и позволяет уменьшить штраф наполовину. А наличие частичной переплаты снизит наказание в соответствующей доле.

Однако, если в ходе проверки будет установлен умысел налогоплательщика занизить сумму налога, от штрафа не спасет даже положительное сальдо.

Источник